O esgoto doméstico é a principal forma de poluição das águas no Brasil, mas as grandes indústrias também poluem. Elas lançam nos rios os resíduos de sua produção. São produtos químicos muito tóxicos e malcheirosos, que destróem a vida dos rios. Os governos de vários países exigem que as indústrias limpem os dejetos antes de lançá-los em águas limpas, mas as fábricas nem sempre respeitam as leis.

A poluição do ar e do solo também acaba indo para a água. A fumaça dos carros e das indústrias provoca a chuva ácida. Os agrotóxicos usados nas plantações são tragados pela água das chuvas, que correm até o rio mais próximo. A preservação das fontes de água potável (que pode ser bebida) e a obtenção de água para a indústria e a agricultura são grandes desafios ambientais para os próximos anos.